Publications by Gerben Menschaert

Publications by Gerben Menschaert

60 publications

2026

2025

Translon : a single term for translated regions

M. Świrski, J. Tierney, M. Albà, D. Andreev, J. Aspden, J. Atkins, M. Bassani-Sternberg, M. Berry, S. Biffo, K. Boris-Lawrie, M. Borodovsky, I. Brierley, M. Brook, M. Brunet, J. Bujnicki, N. Caliskan, L. Calviello, A. Carvunis, J. Cate, C. Cenik, K. Chang, Y. Chen, S. Chothani, J. Choudhary, P. Clark, J. Clauwaert, L. Cooley, E. Dassi, K. Dean, J. Diaz, C. Dieterich, R. Dikstein, J. Dinman, S. Dmitriev, O. Dontsova, C. Dunham, S. Eswarappa, P. Farabaugh, P. Faridi, I. Fierro-Monti, A. Firth, D. Gatfield, F. Gebauer, M. Gelfand, N. Gray, R. Green, C. Hill, Y. Hou, N. Hübner, Z. Ignatova, P. Ivanov, S. Iwasaki, R. Johnson, A. Jomaa, M. Jovanovic, I. Jungreis, M. Kellis, J. Kieft, A. Kochetov, E. Koonin, A. Korostelev, J. Kufel, I. Kulakovskiy, L. Kurian, D. Lafontaine, O. Larsson, G. Loughran, J. Lukeš, M. Mariotti, E. Martens-Uzunova, T. Martinez, A. Matsumoto, J. McManus, J. Medenbach, S. Melnikov, G. Menschaert, C. Merchante, M. Mikl, W. Miller, O. Mühlemann, O. Namy, D. Nedialkova, J. Nosek, S. Orchard, P. Ozretić, M. Pertea, D. Pervouchine, L. Romão, D. Ron, X. Roucou, M. Rubtsova, J. Ruiz-Orera, A. Saghatelian, S. Salzberg, L. Seale, C. Seoighe, P. Sergiev, P. Shah, N. Shirokikh, S. Slavoff, N. Sonenberg, T. Stasevich, R. Szczesny, T. Tamm, M. Tchórzewski, I. Topisirovic, M. Tremblay, T. Tuller, I. Ulitsky, L. Valášek, P. Van Damme, G. Viero, J. Vizcaino, C. Vogel, E. Wallace, J. Weissman, E. Westhof, N. Whiffin, D. Wilson, Z. Xie, J. Yewdell, M. Yordanova, C. Yu, V. Yurchenko, B. Zagrovic, [. TRANSLACORE, M. Almeida, N. Atabey, N. Balatsos, P. Baranov, A. Bojan, T. Choli-Papadopoulou, P. Close, V. Cowling, E. Dassi, A. David, K. Dean, J. Diaz, A. Eftimov, F. Gebauer, M. Helm, C. Iuga, D. Jurkovičová, A. Kanopka, D. Lafontaine, E. Martens-Uzunova, L. Messingerová, H. Nielsen, P. Ozretić, M. Ozturk, V. Pelechano, M. Penzo, P. Podszywalow-Bartnicka, L. Pojskić, J. Le Quesne, L. Romão, B. Rotblat, A. Stanhill, G. Stoecklin, T. Tamm, M. Tchorzewski, V. Trajković, L. Valasek, E. Valen, S. Volarevic, L. Vucicevic, K. Watt, A. Willis, M. Zdralevic, T. Ramuta, E. Valen, P. Baranov

NATURE METHODS · 22 · 2002–2006

2022

Standardized annotation of translated open reading frames

J. Mudge, J. Ruiz-Orera, J. Prensner, M. Brunet, F. Calvet, I. Jungreis, J. Gonzalez, M. Magrane, T. Martinez, J. Schulz, Y. Yang, M. Alba, J. Aspden, P. Baranov, A. Bazzini, E. Bruford, M. Martin, L. Calviello, A. Carvunis, J. Chen, J. Couso, E. Deutsch, P. Flicek, A. Frankish, M. Gerstein, N. Hubner, N. Ingolia, M. Kellis, G. Menschaert, R. Moritz, U. Ohler, X. Roucou, A. Saghatelian, J. Weissman, S. van Heesch

NATURE BIOTECHNOLOGY · 40 · 994–999

2021

Downregulation of the FTO m(6)A RNA demethylase promotes EMT-mediated progression of epithelial tumors and sensitivity to Wnt inhibitors

J. Jeschke, E. Collignon, C. Al Wardi, M. Krayem, M. Bizet, Y. Jia, S. Garaud, Z. Wimana, E. Calonne, B. Hassabi, R. Morandini, R. Deplus, P. Putmans, G. Dube, N. Singh, A. Koch, K. Shostak, L. Rizzotto, R. Ross, C. Desmedt, Y. Bareche, F. Rothe, J. Lehmann-Che, M. Duterque-Coquillaud, X. Leroy, G. Menschaert, L. Teixeira, M. Guo, P. Limbach, P. Close, A. Chariot, E. Leucci, G. Ghanem, B. Yuan, K. Willard-Gallo, C. Sotiriou, J. Marine, F. Fuks

NATURE CANCER · 2 · 611–628